Вход в пещеру представляет собой конусовидную воронку размером 4,7 на 3,8 метра с глубиной до сужения 5 м. Высота входа над уровнем моря составляет 325 м.
Пещера Айдашинская сложена из темно-серых плитчатых известняков рифея.
Пещера имеет карстовое происхождение и состоит из одного этажа.
Температура воздуха в пещере составляет +5°C, относительная влажность примерно 95%.
В основном в пещере распространены глыбовые, земляные и щебнистые отложения, натечные образования отсутствуют.
В 70-е годы 20 века в ней проводились археологические раскопки, в результате которых в осадочном заполнении было найдено большое количество предметов древности, относящимся к 1 тысячелетию до нашей эры. В то время пещера была культовым местом. Найденные предметы древности в настоящее время хранятся в Ачинском краеведческом музее.
Сама пещера – это конусообразный колодец, который соединяет с поверхностью единственный грот, поэтому пещера является некатегорийной.
Пещера была исследована археологами в 1897 г под руководством наставника Красноярской семинарии П.С.Проскурякова. В 70-е годы 20 века в ней проводились археологические раскопки.